In linea di massima devi aspettare del tempo che la cache delle icone si ricrei, se invece vuoi risolvere subito il problema, e per subito intendo con qualcosa di mirato e facilmente applicabile c'è Delete Bookmark Icons.
Potete farlo per una singola icona, oppure per tutte svuotando di fatto la cache.
Detto questo vi do il sito dell'autore dove l'estensione è più aggiornata.
Buona cancellazione.