No, la deframmentazione ha senso solo su supporti in cui ci sia una testina che si deve spostare per leggere/scrivere dati perché più i dati sono vicini, meno tempo impiega a farlo e meno si usura nel movimento...
In una chiavetta USB è anzi dannoso perché gli imponi tanti cicli di lettura e scrittura inutili e si sa che le chiavette un numero di cicli limitati prima di salutarci.