Io uso True Crypt 6.1 in versione portable. A volte ho l' inconveniente che, una volta chiuso, per riaprirlo devo riavviare il sistema. Questo disguido lo potrei ovviare con la versione installabile. Ad ogni modo, con questo programma crei un file al quale dai una dimensione a piacere tuo... il mio, ad esempio, è da 2 giga. All' interno di questo file gli metti tutto quello che vuoi e poi scegli l' algoritmo per criptarlo. Nel caso cerca di documentarti prima di procedere visto che ci sono varie possibilità di configurazione del programma. Una volta creato questo file lo potrai aprire solo con la password da te impostata e creerà un nuovo volume chiedendoti quale lettera assegnargli, fino a che non chiudi il programma.
Qui c' è una breve descrizione
http://www.programmifree.com/categorie/criptare.htm