Ciao.
Non specifichi che distribuzione stai utilizzando, anche se mi sembra di intuire che è Ubuntu.
Potrebbe essere il
gestore delle finestre che non viene caricato correttamente o che va in crash...
... prova a cambiare l'impostazione da
Sistema>Preferenze>Aspetto>Effetti visivi su
Nessuno e poi riportarla ad
Aggiuntivi...
... vedi se ti ricompare la finestra completa.
Se con
Nessuno tutto funziona e con
Aggiuntivi no, potrebbe esserci qualche problema a livello di configurazione nelle impostazioni utente che manda in crash il gestore... in questo caso è possibile rimuovere la configurazione e far in modo che venga reimpostata quella di default.